חיסון
ניתן לחסן נגד חיידק השחפת באמצעות חיסון ב- Bacille Calmette Guerin(BCG) כדי לגרום ליצירת זיהום ראשוני מחיידק מוחלש, ובכך למנוע הדבקה בחיידק האלים. ה-BCG הוא חיסון באמצעות זן שחפת פרות שהוחלש מעבדתית. בטיחותו ויעילותו של החיסון שנויים במחלוקת למרות עשרות שנות שימוש.
החיסרון הגדול של החיסון: הופך את מקבליו לבעלי תבחין טוברקולין חיובי.
• החיסון אינו מאפשר שימוש במבחן הטוברקולין כאמצעי לסריקה ואיתור חולים.
• אין לחסן אנשים בעלי מבחן טוברקולין חיובי מחשש להתלקחות מחלה רדומה.

תופעות לוואי
כחודש לאחר מתן החיסון יכולים להופיע באזור ההזרקה אודם, נפיחות והגדלת בלוטות הלימפה האזוריות (היווצרות קומפלקס ראשוני). תופעת לוואי נדירה היא התפתחות מורסה באזור ההזרקה. יש לבצע מעקב אך לרוב אין מטפלים בה. הטיפול הוא באמצעות חבישה מקומית והרטבות קרות. ניתן בד"כ לראות באזור המורסה סינוס מפריש. ההפרשה הנה סרוטית דמוית מוגלה אך אין הדבר מחייב טיפול אנטיביוטי אלא במקרה של זיהום חיידקי אחר, במקרה זה, מקובל לקחת תרבית מהנוזל.

DOTS - הריפוי לכולם
• הטיפול התרופתי נקבע ע”י הרופא  במרכז למחלות שחפת \ מרכז למחלות ריאה.
• יש לקחת את הטיפול באופן סדיר ומלא (לפחות 6 חודשים) בהשגחה ישירה (DOTS).
• כל הפסקה או אי השלמת טיפול עשויה לגרום להישנות המחלה ואף להתפתחות זנים עמידים לתרופות.
•  החולה מגיע למעקב במרכז לשחפת, אחת לחודש, לבדיקת רופא, בדיקת אחות ובדיקות נוספות.
הטיפול בחולי שחפת הוא בשיטת טיפול בהשגחה ישירה:    Directly  Observed  Therapy Short Course - DOT
טיפול בהשגחה ישירה -מתבצע באמצעות מערך של  משגיחים
משגיח - אדם המכיר את החולה ,לא מבני משפחתו, והביע הסכמתו להיות אחראי על מתן הטיפול באופן קבוע ומוסכם על החולה, על מרכז השחפת ועל נציג לשכת הבריאות. על פי רוב הטיפול ניתן ע"י אחיות קופ"ח.
המשגיח (נותן הטיפול) מקבל את פרטי המטופל ואופן הטיפול בע”פ ובכתב .
התרופות נשלחות למשגיח ע”י שליח  בצרוף דף הנחיות הטיפול, חתום ע”י רופא המלש”ח ודף חתימות.      
דף ההנחיות ודף החתימות מתויקים  בקלסר המיועד לחולי שחפת בלבד.
המטופל בולע את התרופות בנוכחות המשגיח
המשגיח מאשר בציון  שמו המלא  בדף החתימות, את לקיחת התרופה ע”י המטופל בכל יום.  כל זאת רק לאחר שראה כי המטופל בלע את כל התרופות.

אירועים המחייבים דיווח מיידי של המשגיח למלש”ח
• דיווח של המטופל על תופעות לוואי
• קושי בנטילת התרופות
• אי הגעת המטופל לקבלת טיפול במועד שנקבע

שחפת  טיפול מונע
• למי שמוגדר כמגע הדוק של חולה שחפת פעילה ומדבקת, מומלץ לתת טיפול מונע
   מכאן החשיבות בקביעה ברורה מי הוא המגע ההדוק מתוך כלל המגעים של חולה שחפת.
• הטיפול ממושך, שישה חודשים, בגלל אופיים של חיידקי השחפת המתרבים באופן איטי מאוד. הטיפול  התרופתי פעיל נגד החיידקים רק בשלב ההתרבות.
• טיפול מונע לקטין עד גיל 18 שנים יינתן בהשגחה ישירה -DOT  ולא על ידי בני משפחתו.

(הגרפים נלקחו מנתוני משרד הבריאות)